目前，世界上已知的咖啡樹種類有幾十種，但主要有三種原種——阿拉比卡咖啡樹、羅布斯塔咖啡樹和利比里亞咖啡樹。由于品質和產量的因素，前兩個品種是最常見的，可以細分為更多的品種。不同品種的咖啡豆有不同的口味，但即使是同一品種的咖啡樹，由于受不同土壤、不同氣候等的影響，長出來的咖啡豆也有自己獨特的風味。

阿拉比卡(Arabica)其咖啡因含量1％―1.7％，只有羅布斯達種的一半，因此也較健康。其分支包括第皮卡、波旁、牙買加藍山等。阿拉比卡多生長在海拔900米-2000米高度之間；較耐寒，適宜的生長溫度為15―24℃；需較大的濕度，年降雨量不少于1500毫升，同時，對栽培技術和條件也要求較高，不過由于其生長速度快、品質細膩、風味濃醇的特點，一直是世界產銷量最大的品種，約占全世界產量的70％。

阿拉比卡咖啡最大的產地是南美地區。巴西、哥倫比亞、牙買加等全世界最主要的咖啡產地，所出產的品種就是阿拉比卡。另外在埃塞俄比亞、坦桑尼亞、安哥拉、肯尼亞、巴布亞新幾內亞、夏威夷、菲律賓、印度、印度尼西亞等地也有大面積種植。

羅巴斯塔種咖啡樹耐高溫、耐寒、 耐濕、 耐旱，甚至還耐霉菌侵擾。就栽種方面來說，羅巴斯塔種咖啡樹有百般好處，多種植在海拔200-600米的低地，喜歡溫暖的氣候，要求溫度是24～29℃，對降雨量的要求并不高，但是，該品種要靠昆蟲或風力傳授花粉，所以，咖啡從授粉到結果要9―11個月時間，相對阿拉比卡種要長。只可惜生產出的咖啡豆香氣較差、苦味強、酸度又不足，而且咖啡因含量是阿拉比加種的一倍。羅巴斯塔口啡豆口道上較有個性，多用做混合調配或即溶咖啡之用。羅巴斯塔種咖啡豆多數顆粒較小，形狀大小不一，外觀不甚好看。

羅布斯塔羅布斯塔主要種植于東南亞地區、非洲中西部地區以及巴西科地區，目前產量約占世界總產量的1/3。由于該品種對環境適應力強，不易受病蟲害侵襲，易于管理，價格低廉，因此產量有逐年增長的趨勢。